1、重庆市户籍居民可向全市公安机关任一出入境窗口提出申请。
2、现役的人民解放军军人、人民武装警察向所属部队驻地公安机关出入境窗口或重庆市公安局出入境管理局提出申请。
4、非渝户籍人员参照《“全国通办”申请指南》《持居住证异地办理出入境证件申请指南》。
委托代办：持有效大陆居民往来台湾通行证向原证件或原签注受理机构申请签注的(旅游签注除外)，可以委托他人代为申请。委托他人代办的，应当提交往来台湾通行证和被委托人的居民身份证(未成年监护人委托代办的还需提交委托书和监护人的身份证或户口簿)。申请人在境外的，不得委托他人代为申请。
二、办证流程
申请人前往公安机关出入境管理部门免费采集出入境证件照(持有效往来台湾通行证申请赴台湾签注的免采集)→填写申请表→提交申请材料→缴纳证件工本费→领取证件。
三、办证时限及领证方式
2、证件办结后申请人到原受理机关领取或通过邮政快递方式送达证件。其中快递取证属于有偿服务，收件时支付邮费。具体详见《受理回执》。
四、收费标准
大陆居民往来台湾通行证60元/张；一次签注15元/件；多次签注80元/件。
五、赴台团队旅游
赴台团队旅游需提交以下材料：
(一)团队旅游1次有效：
2、居民身份证(未满16周岁的除外)(居民身份证在申领、换补发期间，可提交临时身份证)。
3、未满16周岁公民应当提交居民身份证或者户口簿，并应当由监护人陪同申请，同时提交监护人的居民身份证和监护关系证明(在户政部门已登记或曾提交过监护关系证明的免交)；监护人无法陪同的，可以委托他人陪同，被委托人还应当提交本人居民身份证，监护人的居民身份证或户口簿和监护人的委托书。
监护关系证明包括：《出生医学证明》、载明监护关系的户口簿、户口所在地公安派出所出具的亲属关系证明、监护关系公证书。
4、定居国外的中国公民应提交本人有效的《中华人民共和国护照》或《中华人民共和国旅行证》、定居国外的证明。
5、现役的人民解放军军人、人民武装警察应当提交军官证、士兵证或者警官证。
6、按规定提交或核验指纹信息。
7、属于登记备案的国家工作人员和现役的人民解放军军人、人民武装警察，每次申请均需提交本人所属工作单位或者上级主管单位出具的同意办理出入境证件的证明。
8、持有效《大陆居民往来台湾通行证》申请赴台签注的，应当提交原证件。
(二)团队旅游多次有效：
团队旅游多次有效：除提交同“团队旅游1次有效”申请材料以外，还需提交申请人所在赴台组团旅行社出具的在职证明和有效的赴台旅游团队领队证。
六、应邀赴台
除需提交“团队旅游1次有效”申请基本材料外，另需提交以下材料：
3、申请“赴台学习”签注，应当提交开放赴台就学省份的设区市以上台办出具的《赴台学习证明》。
七、因私情况赴台
常住户口在我市的大陆居民和定居国外的中国公民来大陆后，因私事前往台湾探亲、定居、访友、接受和处理财产、婚丧及其他私人事务的，除需提交“团队旅游1次有效”申请基本材料外，另需提交有效的入台许可或经确认能够进入台湾地区的有关证明。